Чудните мостове са резултат от активната карстова дейност на реката в мощните мрамори на рида Чернатица. В геоложкото минало река Дълбок дол била буйна и многоводна. В продължение на хилядолетия тя постепенно си проправяла път през вертикалните пукнатини
