В манастирския храм той се поклони пред чудотворната икона на Света Богородица и пред гроба на цар Борис Трети. Монашеството посрещна и изпрати отеца с камбанен звън.

Малкото дошли поклонници и граждани посрещнаха отеца с ръкопляскания и викове. Папа Йоан Павел Втори бе въведен в манастирския храм лично от игумена отец Йоан.

В словото си игуменът припомни искането на покойния папа Йоан 23 да присъства на тържествата по случай годишнина от смърта на свети Иван Рилски. "Днес, Вие изпълнихте това негово желание", обърна се към папата отец Йоан. Той благодари на Светия отец, че при краткото си пребиваване в нашата страна е благоволил да посети най-голямата българска светиня - Рилския манастир. В словото си епископ Йоан добави, че човеци са изградили стените на разделението на християнската църква и човеци ще ги разрушат.

"Римският епископ е тук днес, за да ви каже, че Римската църква и нейните монаси са ви благодарни за Вашето съществуване и Вашето християнско свидетелство" - с тези думи папа Йоан Павел Втори се обърна към духовниците в манастира.
"Източното монашество, заедно със западното, представлява един голям дар за цялата църква", каза още в словото си папата.

Той се помоли пред гроба на цар Борис Трети и отиде в Иконната зала. Там се срещна с премиера и семейството му.

Въпреки засилените охранителни мерки, малкото дошли да видят на живо и поздравят папата, не спираха да го аплодират през целия му път.

Само с един инцидент премина тържествената церемония - припадна 40-годишен полицай от Дупница.

Камбаните на манастира забиха отново в 11.30 часа, когато римският папа напускаше Рилската света обител. Той благослови две български деца, които охраната допусна до Светия отец.

След завръщането си от Рилския манастир в София днес, папа Йоан Павел Втори е благодарил лично на директора на Националната служба за охрана, генерал Димитър Владимиров, за перфектната организация на посещението му.