Подготовката на документа като стратегията за защита на морската среда е признание на факта, че има остра нужда от предотвратяване на последиците от промените в климата, свръхвисокия улов на риба, и замърсяванията като цяло.
Всеки воден басейн има своите специфични проблеми. Затова говорейки за общите усилия Европейският съюз в същото време признава, че е необходима и регионална политика.
Всяко море има свои проблеми, така че изискванията на отделните райони са различни. Местните власти и местните хора познават по-добре проблемите и знаят как да се справят с тях в рамките на една Европейска стратегия за морската среда.
Пример за разрушителното въздействие върху моретата са заливите между Швеция и Финландия. Те имат уникална флора и фауна, но и естествените процеси и човешката дейност разрушават тази екосистема. ЕС смята, че 90% от замърсяването идва от вътрешността на сушата.
Като начало, моретата и океанът около Европа ще бъдат разделени на пет зони - Балтика, Черно море, Североатлантически район, Северен район и Средиземноморие. Специално за Черно море като сериозни проблеми се изтъкват замърсяването и прекомерния улов на риба.
