Организаторите на нападението са били обучавани в лагери на "Ал Кайда" в Афганистан и Пакистан, обяви военният министър на Индонезия. Властите обвиниха за атентата ислямистката организация "Джемаа Исламия", която има връзки с мрежата на Осама бен Ладен. Според правителството тази групировка стои и зад терористичния акт на остров Бали миналия октомври. Американското правителство смята, че екстремисти планират още атаки. Държавният департамент предупреди американските граждани да се въздържат от пътувания до Индонезия. Уточнява се, че заради повишените мерки за сигурност около административните сгради, терористите могат да ударят "по-леки" цели, като хотели, ресторанти, търговски центрове, училища и църкви.