Средства на Фонда за лечение на деца са били използвани за финансирането на 2-годишно обучение на служителите по английски и немски език, въпреки че в длъжностната им характеристика е записано изискване за съответната езикова компетентност. Това е само едно от нарушенията, констатирани в структурата и заради които бившият директор Павел Александров и три служителки отиват на съд.
В нарушение на закона, той (а не Министерството на здравеопазването) определил главния експерт Катерина Котева за свой заместник. Според прокуратурата през септември 2014 г. Александров мотивирал за участие в престъпното сдружение нея, икономиста Татяна Радева и контрольора на дейността на фонда Станислава Горанова.
Сред практиките за неправомерно изразходване на пари от бюджета на фонда е командироването в чужбина на лекари от различни болници, макар нормативната уредба да не позволява такива действия.
Александров подписвал без обществени поръчки договори за лечение на деца в чужбина, главно в болница „Аджъбадем”, Турция. Решенията били еднолични и с неясни критерии от шефа на фонда, който не е лекар.
Той и Котева попълвали без нужните правомощия и формуляри S2, с които задължават НЗОК да плаща на чужди болници за лечението на български деца. Междувременно Радева не упражнявала предварителен контрол и не издавала контролни листа за поети финансови задължения.
Арестът на Александров създаде криза във Фонда за лечение на деца, като голяма част от членовете на Обществения му съвет обвиниха здравното министерство в опит да си „присвои” структурата.