Славиша Йоканович е роден на 16 август 1968 година в Нови Сад (Югославия). Започва да играе футбол във Войводина (Нови Сад), къдто в периода 1988-1990-та година изиграва 54 мача и вкарва 10 гола. В периода 1990-1993 година е футболист на Партизан (Белград), където изиграва 61 мача и вкарва 20 гола.
След това Славиша Йоканович играе за испанските Овиедо (1993-1995 година), Тенерифе (1995-1999), Депортиво Ла Коруня (1999-2000).
През 2000-та година Славиша Йоканович преминава в английския Челси, където в периода 2000-2002 година изиграва 39 мача.
Като футболист на Челси Славиша Йоканович играе през 2001 година срещу Левски в мач от турнира за купата на УЕФА в София.
Йоканович приключва кариерата си като футболист през 2004 година като играч на втородивизионния испански отбор Мурсия. Славиша Йоканович има 61 мача като национален състезател на Югославия, по-късно национален отбор на Сърбия и Черна гора, в които е вкарал 10 гола.
Йоканович като футболист на Югославия играе на финалите на световното първенство през 1998 година и на финалите на европейското първенство през 2000-та година.
Като треньор Славиша Йоканович работи в Партизан /Белград/ в периода 2007-2009 година. През 2008 година под ръководството на Йоканович отборът на Партизан печели първенството и купата на Сърбия, през 2009 година пак под негово ръководство Партизан прави дубъл - първенство и купа на Сърбия.
На 5 септември 2009 година Йоканович напуска Партизан по взаимно съгласие.
Славиша Йоканович на 28 февруари 2012 година става старши треньор на Муангтон юнайтед, с който става шампион на Тайланд.
