Двамата китайски астронавти на борда на кораба се чувстват добре след завръщането си на Земята. Совалката се приземи тази нощ в китайския автономен район Вътрешна Монголия само на един километър от предвиденото място.

Полетът беше втората космическа мисия на Китай след историческия Шънчжоу-5. Той направи Китай третата държава, изпратила човек в космоса. Шънчжоу-6 извърши 76 обиколки около земята и измина над 3 милиона километра. Мисията е направила планираните експерименти и е събрала ценни технически данни за китайската програма за пилотирани полети в космоса. Китай планира още един пилотиран космически полет за 2007 година, след което възнамерява да изгради своя орбитална космическа станция.