Маргарита Пешева е председател на Съвета за електронни медии. Тя е първият председател на Съвета и негов член от 2001 г. Занимава се с изследвания на електронните медии, техните връзки и отношения с класическите изкуства, проблемите на художествения синтез, медийната репродукция и цивилизацията на тиражите, медийните митологии и др.
От 1990 г. наблюдава и анализира ролята на българската телевизия в условията на избори, нейните езикови практики и отношения с политиката. Автор е на повече от десет книги, между които "Телевизията – политическата машина" (1993), "Дворецът на Дедал. Телевизионният лабиринт" (1995), "Телевизия в преход" (1998), "Брод. Визуалната култура 2000-1986" (2000), "Обърнатото огледало" (2003) и др. В подготовка е новата й книга "Политическият лозунг 1946-2006".
Преподава медийна регулация и законодателство в УНСС, управление на медиите във Варненския свободен университет и журналистика и култура в Бургаския свободен университет.
